Il est diplômé de la faculté de médecine de l'Université d'Istanbul d'Istanbul en 1985. Il a terminé sa résidence en cardiologie à l'hôpital d'État d'Izmir Atatürk en 1996. Il est membre de la Société turque de cardiologie et de la Société européenne de cardiologie. Marié et père de trois enfants, Dr. Dr. Çetin Aydın parle couramment l'anglais.